Կենտրոնական ապարատ
Միջազգային և հասարակայնության հետ կապերի բաժին
Կիբերանվտանգության և տեղեկատվական համակարգերի բաժին
Վարակիչ հիվանդությունների համճարակաբանության վարչություն
Իմունականխարգելման և կառավարելի վարակիչ հիվանդությունների համաճարակաբանության վարչություն
Շրջակա միջավայրի հիգիենայի բաժին
Մեկ առողջության, զոոնոզ և մակաբուծային հիվանդությունների համաճարակաբանության բաժին
Անձնակազմի կառավարման բաժին
Ֆինանսատնտեսագիտական բաժին
Նյութատեխնիկական ապահովման և տնտեսական բաժին
Հանրային առողջապահության արտակարգ գործառնական կենտրոն
Բժշկական իմունակենսաբանական պատրաստուկների բաժին
Հաշվապահական հաշվառման բաժին
Ոչ վարակիչ հիվանդությունների կանխարգելման և առողջության խթանման բաժին
Վերլուծության և վիճակագրության բաժին
Իմունականխարգելման և ճանապարհորդների սպասարկման կաբինետ
